MASTER - Domaine Sciences, Technologies, Santé, Mention Chimie, Spécialité In Silico Drug Design (Conception de Médicaments Assistée par Ordinateur

Activités visées :

- Recherche in silico de nouvelles molécules thérapeutiques.

- Analyse structurale des macromolécules et de leurs implications dans des pathologies

- Développement de logiciels et méthodologies permettant de participer à la découverte de nouveaux médicaments.

- Gestion et résolution de problèmes dans les différents domaines du Drug Design in silico

- Criblage à haut débit in silico

Compétences attestées :

Compétences organisationnelles :

- Travailler de manière autonome : établir des priorités, gérer son temps, s’auto-évaluer, élaborer un projet personnel de formation.

- Utiliser les technologies de l’information et de la communication.

- Effectuer une recherche d’information : préciser l’objet de la recherche, identifier les modes d’accès, analyser la pertinence, expliquer et transmettre.

- Mettre en œuvre un projet: définir les objectifs et le contexte, réaliser et évaluer l’action.

- Réaliser une étude : poser une problématique ; construire et développer une argumentation ; interpréter les résultats ; élaborer une synthèse ; proposer des prolongements.

Compétences relationnelles :

- Communiquer : rédiger clairement, préparer des supports de communication adaptés, prendre la parole en public et commenter des supports, communiquer en langues étrangères (compréhension et expression écrites et orales)

- Travailler en équipe : s’intégrer, se positionner, collaborer, s’adapter à différents fonctionnements de recherche

- Savoir dialoguer et travailler avec les différents partenaires, du privé ou du publique, dans le domaine de l’informatique, de la chimie, de la biologie structurale, des biostatistiques et bioinformaticiens et de la chemoinformatique.

- S’intégrer dans un milieu professionnel (I) : identifier ses compétences et les communiquer, situer une entreprise ou une organisation dans son contexte socio-économique, identifier les personnes ressources et les diverses fonctions d’une organisation, se situer dans un environnement hiérarchique et fonctionnel, respecter les procédures, la législation et les normes de sécurité, s’adapter aux différents fonctionnements

Compétences scientifiques générales :

- Appréhender un problème biologique donné et mettre en œuvre ou développer les collaborations et les outils adaptés à la problématique posée.

- Connaître et respecter les réglementations,

- Faire preuve de capacité d’abstraction

- Analyser une situation complexe

- Adopter une approche pluridisciplinaire

- Appréhender les difficultés des démarches expérimentales (U), être sensibilisé aux sources d’erreur ; analyser des données expérimentales et envisager leur modélisation ; valider un modèle par comparaison de ses prévisions aux résultats expérimentaux ; apprécier les limites de validité d’un modèle ; résoudre par approximations successives un problème complexe

- Utiliser des logiciels d’acquisition et d’analyse de données

- Utiliser des outils mathématiques et statistiques

- Utiliser un langage de programmation

Sciences de la Vie

- Utiliser des logiciels et méthodes de bioinformatique et de bioinformatique structurale

- Initiation à plusieurs approches biophysiques (calorimétrie, RMN…)

- Manipuler les tests statistiques de base

- Initiation aux techniques de biochimie (I) : méthodes de séparation et purification, dosage et analyse spectro photométriques.

Chimie

- Connaissance des principales techniques de spectroscopie (IR, UV, visible, RMN…) (U)

- Connaissance de base en chimie médicinale

- Connaissance en chémoinformatique

- Maitriser les outils de criblage in silico

- Principes fondamentaux d’ADME/Tox et préparation des chimiothèques.

Mathématiques des logiciels de calcul (scientifique ou symbolique) (M) : statistiques, probabilités, critères de validité de tests, évaluation des risques...

- Maîtriser les principales techniques de base d'au moins deux autres disciplines scientifiques afin d'être un interlocuteur ouvert au dialogue interdisciplinaire

- Manipuler les principaux modèles mathématiques intervenants dans différentes disciplines ou applications en sciences du vivant, en chimie

Informatique

- Apprentissage des langages informatiques (Python, Perl, Java…) et de la programmation objet

- Mettre en oeuvre des méthodes d’analyse pour concevoir des applications et algorithmes à partir d’un cahier des charges partiellement donné

- Choisir, sur des critères objectifs, des structures de données les mieux adaptées à un problème et mettre en oeuvre des concepts de l’approche objet.